Выступать на высоком уровне Боккетти начал с 2008 года, когда он оставил позади себя клубы низших лиг и перебрался в Геную. В «Дженоа» Сальваторе провел 60 матчей и дослужился до сборной Италии, в майке которой выходил на поле 5 раз и являлся одним из кандидатов на поездку в ЮАР на мировое первенство.